Différences entre microbiote et microbiome

Quelles sont les différences entre microbiome et microbiote? Découvrez l'importance de prendre soin des micro-organismes qui habitent le corps pour atteindre une bonne santé.
Différences entre microbiote et microbiome
Saúl Sánchez

Rédigé et vérifié par el nutricionista Saúl Sánchez.

Dernière mise à jour : 24 janvier, 2023

Le microbiome et le microbiote sont deux concepts différents qui affectent l’état de santé. Il existe des preuves de leur influence sur le fonctionnement du corps. Les deux doivent avoir une composition optimale pour réduire le risque de développer des pathologies chroniques et complexes à moyen terme.

La première chose à savoir avant d’énoncer les différences est que le microbiome et le microbiote ont été étudiés il y a quelques années. Il existe encore de nombreuses inconnues à cet égard, tant sur le plan physiologique qu’en termes de matériel génétique. Au fur et à mesure des nouvelles découvertes, la capacité à prévenir les troubles de la fonction gastro-intestinale est également améliorée.

Qu’est-ce que le microbiome ?

Sous le nom de microbiome, nous désignons l’ensemble des microbes qui habitent l’organisme, ainsi que leurs gènes et métabolites. Nous parlons de virus, d’archées, de bactéries, de champignons et de protistes. C’est une composante importante dans le cadre de la médecine personnalisée, puisque tout cet ensemble d’éléments peuvent influencer les réactions physiologiques et la réponse d’une personne à divers traitements.

Il est important de garder à l’esprit que des micro-organismes procaryotes unicellulaires, des bactéries plus grandes qui vivent et se reproduisent de manière autonome, des êtres eucaryotes avec du matériel génétique organisé dans la cellule au sein du noyau, des champignons unicellulaires et des protozoaires unicellulaires peuvent coexister dans le corps. Certains de ces éléments peuvent devenir pathogènes, bien que la plupart d’entre nous parlent d’organismes bénéfiques ou mutualistes.

Ce qui est certain, c’est que le corps humain n’est pas du tout un environnement stérile. De nombreux micro-organismes différents y coexistent et la diversité est nécessaire pour atteindre une bonne santé.

On ne les trouve pas seulement dans le tube digestif, mais tous ces organismes peuvent se trouver sur la peau, dans les voies respiratoires et dans toute cavité qui maintient un certain degré d’humidité.

Qu’est-ce que le microbiote ?

Le microbiote intestinal est très important

Sous le nom de microbiote, nous désignons seulement les micro-organismes qui résident dans l’organisme. Normalement, sous ce terme, les bactéries qui font partie du tube digestif sont nommées. Les profils peuvent varier selon les personnes et, aujourd’hui, dans son ensemble, nous classons le microbiote comme un organe.

Plusieurs facteurs peuvent provoquer un déséquilibre des bactéries dans le corps. Par exemple, elles sont fortement influencées par le stress, par le type d’allaitement, par la prise d’antibiotiques ou par l’alimentation. En ce sens, il est nécessaire de prendre soin des habitudes de vie pour atteindre un état d’équilibre dans l’environnement interne. En effet, il est prouvé que le microbiote peut avoir une influence décisive sur la santé mentale.

Ces dernières années, les différents profils du microbiote ont été beaucoup étudiés, en essayant d’analyser leur comportement à la fois dans la santé et dans la maladie. L’altération de ces micro-organismes pourrait provoquer des maladies auto-immunes voire des problèmes inflammatoires. Cela est également lié à certains types de cancer, selon une étude publiée dans la revue Clinical Gastroenterology and Hepatology.

Il est clair que le microbiote a une influence déterminante sur l’efficacité des processus physiologiques et métaboliques. En effet, il peut conditionner l’absorption des nutriments. De nombreuses bactéries présentes dans le tube digestif sont capables de produire des enzymes qui facilitent la digestion, telles que la lactase. Elles sont également chargés de permettre l’absorption des acides gras issus des interactions avec la bile.

Comment maintenir un microbiote et un microbiome sains?

Il est essentiel d’optimiser le profil du microbiote pour éviter les altérations de l’état de santé. Il est clair que l’alimentation a une influence décisive à cet égard. L’essentiel est de maximiser l’apport de bactéries bénéfiques et de réduire l’apport ou l’arrivée d’agents pathogènes dans le tube digestif, éléments qui pourraient se reproduire, causant des dommages à l’hôte.

L’un des points clés au niveau alimentaire concerne la consommation de produits laitiers fermentés. Ces aliments contiennent des bactéries probiotiques, des micro-organismes qui se sont avérés capables d’avoir un effet bénéfique sur l’état de santé. De plus, aujourd’hui, même la supplémentation avec eux est appréciée dans de nombreux cas.

D’autre part, il sera important d’assurer l’apport en fibres. Cette substance est une épée à double tranchant. C’est le principal substrat énergétique des bactéries qui vivent dans le tube, mais leur croissance ne sera pas sélective. Pour cette raison, face à un processus de dysbiose, la consommation de fibres pourrait augmenter les symptômes. Soyez prudent dans ces cas.

Cependant, en règle générale, les fibres provoquent une augmentation de la densité des microorganismes qui peuplent le tube digestif. Ceci est souvent considéré comme positif, comme l’indiquent des recherches publiées dans la revue Gut Microbes. De plus, grâce à ces composés, une série de nutriments à caractère anti-inflammatoire se forment au niveau intestinal, les acides gras à chaîne courte. Parmi eux, le butyrate se démarque.

Quels sont les facteurs pouvant causer une dysbiose?

Comme nous l’avons vu, plusieurs facteurs conditionnent la santé du microbiote, ce qui peut conduire à une dysbiose au niveau intestinal. Ce problème se pose lorsque des bactéries pathogènes se développent, lorsque la densité en micro-organismes est perdue ou lorsqu’il y a une diminution de la diversité. Dans tous ces cas, une série de symptômes digestifs gênants se produira.

Normalement, les processus de dysbiose sont influencés par la consommation d’antibiotiques. Ces produits sont utilisés pour tuer les infections bactériennes, mais ils ne ciblent pas les bactéries pathogènes de manière sélective. Ils peuvent également réduire les populations de micro-organismes bénéfiques. À partir de là, un milieu de culture optimal est généré pour que d’autres bactéries opportunistes colonisent le tube, provoquant des dommages.

Pour cette raison, la consommation d’un supplément probiotique en association avec des antibiotiques est généralement conseillée. C’est ce qu’indique une étude publiée dans la revue Current Opinion in Biotechnology . D’une part, la diarrhée associée à ces médicaments est réduite. De même, la genèse d’une altération du microbiote qui pourrait conditionner l’état de santé dans le futur sera évitée.

Il sera également important de garantir un apport en fibres dans des conditions normales, pour éviter que la densité des micro-organismes ne diminue et l’apparition de bactéries pathogènes qui colonisent le tube. Les recommandations des experts sont de 25 grammes de fibres par jour, à la fois solubles et insolubles.

Aliments à éviter pour prendre soin du microbiote et du microbiome

Il existe un certain nombre de produits comestibles à éviter dans l’alimentation pour protéger le microbiote intestinal. Tout d’abord, nous devons mentionner les boissons alcoolisées. Celles-ci causent des dommages à de nombreux organes du corps humain. Elles parviennent effectivement à réduire les populations de bactéries bénéfiques, car elles ont un caractère toxique.

De la même manière, il sera essentiel de limiter les apports en sucres simples et en gras trans. Les deux éléments font varier la composition du microbiote, pouvant provoquer des situations de dysbiose dues à la perte de diversité. De plus, nous parlons de composés à caractère inflammatoire. Ceux-ci pourraient influencer négativement le risque de tomber malade, il faudra donc réduire leur apport au niveau alimentaire.

Par ailleurs, ces dernières années, l’utilisation d’édulcorants artificiels a été encouragée pour remplacer le sucre. Il y a beaucoup de controverse concernant ces additifs. S’il est vrai que tous ne sont pas identiques, beaucoup pourraient causer des dommages à l’environnement interne, notamment au niveau du microbiote intestinal. C’est ce qu’atteste une enquête publiée dans le journal EXCLI.

Toutefois, certains édulcorants naturels comme la stévia semblent plus sûrs à cet égard. L’important est qu’ils passent inchangés dans le tube digestif, évitant les fermentations qui peuvent conditionner la survie des bactéries qui vivent dans l’intestin. Sinon, le risque de dysbiose pourrait augmenter à moyen terme. A titre préventif, il est recommandé de modérer sa consommation.

A quel moment introduire un supplément probiotique ?

Le microbiote et l'utilisation de suppléments probiotiques

La vérité est que les suppléments probiotiques peuvent être consommés pour différentes raisons. L’une d’elles est les problèmes digestifs. Lorsque la diarrhée ou la constipation sont fréquentes, ces suppléments pourraient être utiles pour parvenir à une situation de normalité et de bien-être. Néanmoins, il faut choisir la bonne souche.

Les probiotiques peuvent également aider à améliorer la fonction immunitaire. La réduction de la perméabilité du tractus intestinal réduit la possibilité que certains agents pathogènes atteignent la circulation sanguine et soient capables de causer des dommages à l’organisme. Même lesdits micro-organismes bénéfiques serviraient à réduire l’incidence de certaines pathologies chroniques et complexes, telles que celles de type neurodégénératif.

Maintenant, avant d’inclure un supplément probiotique dans la directive, il est toujours conseillé de consulter un spécialiste. Le choix du produit lui-même peut ne pas être facile. Il faudra trouver la bonne souche de bactéries ingérées et choisir un complément qui possède un nombre minimum d’unités formatrices de colonies, afin de garantir leur survie.

Microbiote et microbiome, deux concepts différents

Le microbiote et le microbiome sont deux concepts différents, mais ils font référence à un écosystème très important. Celui des micro-organismes qui peuplent le corps humain. Sans eux, la vie serait impossible, leur survie doit donc être garantie, surtout quand on parle de bactéries bénéfiques. Celles-ci collaborent à de nombreux processus physiologiques et digestifs.

Enfin, si, pour une raison quelconque, vous ressentez un changement dans vos habitudes intestinales, une perte de poids ou une faiblesse, vous devriez consulter un spécialiste. Il est probable que vous ayez développé une situation de dysbiose au niveau intestinal qui doit être corrigée pour revenir à la normale. Dans le cas contraire, le bon fonctionnement de l’organisme pourrait être mis en péril par l’établissement de déficits nutritionnels.



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